
生物信息
用于收集、存储、处理和分析生物学数据的计算机软件或在线平台。这些工具在生物学研究中发挥着重要作用,特别是在基因组学、蛋白质组学、转录组学等领域。
简介:一个权威的、全面的生物物种信息数据库。它收录了全球范围内的各种生物物种的名称、分类、分布等信息,旨在为用户提供准确、可靠的物种信息查询和参考。
简介:提供RNA二级结构预测服务,如mfold工具,帮助研究人员预测和分析RNA分子的结构特征。还有相关领域的研究和工具仍在发展,为RNA结构和功能研究提供支持。
简介:维也纳大学提供的在线工具,用于预测RNA二级结构。用户提交RNA序列后,该工具能计算并返回其最可能的二级结构,包括发夹、凸环等元件,对RNA结构和功能研究具有重要价值。
简介:一个综合性蛋白质相互作用数据库,提供已知蛋白和预测蛋白间的互作信息。它整合了实验数据、文献挖掘、数据库注释等多种资源,支持多种搜索方式,并可视化展示蛋白质互作网络。目前数据库已收录12535个物种,5930万个蛋白,超过200亿种互作关系,是生物学研究和生信分析的重要工具。
简介:专注于基因共表达网络分析的在线工具。它包含约800万个共表达基因数据,这些数据来源于384个人类GEO数据集和248个小鼠GEO数据集。该网站特色在于其共表达基因数据均通过功能关联验证,并与医学主题词(MeSH)相关联,提供丰富的生物医学信息。用户可输入基因ID或Symbol号查询特定基因的共表达网络,结果以图片形式展示,支持多种格式下载。
简介:综合性的motif分析工具集,提供多种用于挖掘、比较和注释motif的工具。它支持DNA、RNA和蛋白质序列的motif分析,帮助研究人员识别序列中的保守模式,进而推断生物功能。MEME是其核心工具之一,基于最大期望值(EM)算法来识别motif。
简介:广州基迪奥生物科技有限公司旗下的在线数据分析与可视化工具。该工具支持基因及代谢组数据的KEGG富集分析,用户可在线筛选通路展示,并动态调整图形颜色、字体等参数,实现个性化图表绘制,助力科研数据的高效分析与可视化展示。
简介:提供蛋白质亚细胞定位预测服务的网站。它汇集了PSORT家族的一系列程序,包括PSORTb、PSORTm、PSORTdb、PSORT II、WoLF PSORT等,这些程序分别适用于细菌与古菌、宏基因组数据、真核序列以及植物序列的亚细胞定位预测。此外,该网站还提供相关的数据集、资源链接以及预测方法的Docker版本,是生物信息学研究中不可或缺的工具平台。
简介:提供蛋白质结构和功能预测服务的在线平台。自1992年上线以来,它已发展成为分子生物学领域的重要工具,支持预测蛋白质的二级结构、跨膜区、溶剂可及性、无序区域等,并提供蛋白质功能注释和互作位点预测等服务,助力生物信息学研究。
简介:线上制图工具,专注于生成三元相图式图表。用户只需输入相关数据,该工具即可快速生成清晰的三元相图,帮助用户直观展示三个变量之间的关系。其界面清晰,操作简单,是数据可视化的一个实用选择。
简介:在线进化树编辑与美化工具。它支持多种格式的进化树文件导入,提供丰富的自定义选项,如调整分支颜色、标签装饰、添加注释信息等。用户可轻松创建高颜值的进化树,并导出为多种格式。还提供了丰富的示例和详细的帮助文档,是学习和科研的得力助手。
简介:专注于系统发育树及其他类型树的展示、注释与管理。用户可上传原始系统发育树文件及注释文件,自由调整树枝、标签的颜色、形状和字体。iTOL支持多种数据集的展示,允许导出高质量的位图和矢量图,是生物信息学研究和教学中不可或缺的工具。
简介:一个基于同源建模的蛋白质3D结构预测工具。它利用已知蛋白质结构作为模板,通过自动同源建模生成目标蛋白质的3D模型。用户可上传蛋白质序列,选择模板进行建模,并使用GMQE和QMEAN等指标评估模型质量。SWISS-MODEL广泛应用于蛋白质结构预测、药物设计等领域。
简介:一款专门用于DNA序列拼接的软件,特别适用于Sanger测序数据的拼接。它提供了在线版和本地版两种使用方式,方便用户根据数据量的大小和需求进行选择。CAP3通过识别序列之间的重叠部分,将多个片段拼接成完整的DNA序列,是生物信息学研究中常用的工具之一。
简介:广州基迪奥生物旗下的在线数据分析工具。该工具支持GO富集分析,用户可上传基因列表进行GO功能显著性分析,并动态调整结果展示,如修改文字样式、图形样式等,助力科研数据的高效分析与可视化。
简介:基迪奥生物旗下云平台提供的一款在线热图绘制工具。它支持用户上传基因表达量数据矩阵表格文件,并可选输入标签文件和分组文件,从而绘制出带有特定标签和分组注释条的热图。该工具操作简便,支持数据归一化、聚类分析等个性化参数设置,且结果美观直观,是生命科学研究中常用的数据分析与可视化工具。
简介:用于生成Circos图。用户只需上传一个文本文件,即可快速生成环状图,展示数据间的关联。该工具操作简便,结果直观,适用于生物信息学、基因组学等领域的数据可视化分析。
简介:电子科技大学建校时间为1956年,占地面积1845亩,隶属于教育部,地址为四川省成都市高新区(西区)西源大道2006号,学校有2个国家重点学科,3个重点实验室,16个博士学科,28个硕士专业学科,属于985,211,双一流,强基计划学校。
简介:基迪奥生物旗下的在线生物信息分析工具,用于针对时间顺序取样的表达量数据进行聚类分析,探索基因表达模式的变化规律。用户可上传数据,选择参数,快速获得趋势分析结果,助力科研数据挖掘与可视化。
简介:用于预测和分析蛋白质的结构、功能和突变。它使用先进的远程同源检测方法来构建蛋白质三维模型,预测配体结合位点,并分析氨基酸突变对蛋白质序列的影响。以其简洁的界面和强大的分析能力,在生物信息学研究中广受欢迎。
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